Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDCL3Q9H2J4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDCL3Q9H2J4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms