Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0H3

KLHL25, Kelch-like protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL25Q9H0H3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KLHL25Q9H0H3 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KLHL25Q9H0H3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KLHL25Q9H0H3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms