Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXD1Q9GZZ0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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