Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC90BQ9GZT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC90BQ9GZT6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms