Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1EQ9GZS1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
POLR1EQ9GZS1 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms