Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM4Q9C037 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM4Q9C037 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms