Protein–RNA interactions for Protein: Q9C026

TRIM9, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM9, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM9Q9C026 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TRIM9Q9C026 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TRIM9Q9C026 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TRIM9Q9C026 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms