Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
NSD3Q9BZ95 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
NSD3Q9BZ95 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.11■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.57
NSD3Q9BZ95 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
NSD3Q9BZ95 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms