Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRIM55Q9BYV6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRIM55Q9BYV6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms