Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RSPO3Q9BXY4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RSPO3Q9BXY4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms