Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SALL3Q9BXA9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SALL3Q9BXA9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.1 ms