Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX74

TM2D1, TM2 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1Q9BX74 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TM2D1Q9BX74 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TM2D1Q9BX74 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms