Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWS9

CHID1, Chitinase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHID1Q9BWS9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CHID1Q9BWS9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHID1Q9BWS9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CHID1Q9BWS9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms