Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
NUP58Q9BVL2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
NUP58Q9BVL2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
NUP58Q9BVL2 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms