Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TRAF4Q9BUZ4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TRAF4Q9BUZ4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.7 ms