Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSR8

YIPF4, Protein YIPF4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF4Q9BSR8 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
YIPF4Q9BSR8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.27■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
YIPF4Q9BSR8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms