Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERPUD2Q9BSE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HERPUD2Q9BSE4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HERPUD2Q9BSE4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms