Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
PAAF1Q9BRP4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PAAF1Q9BRP4 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms