Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PMCHL2Q9BQD1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PMCHL2Q9BQD1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PMCHL2Q9BQD1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.4 ms