Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOL4Q9BPW4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOL4Q9BPW4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms