Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GAL3ST1Q99999 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
GAL3ST1Q99999 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms