Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RBBP8Q99708 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RBBP8Q99708 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RBBP8Q99708 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms