Protein–RNA interactions for Protein: Q99674

CGREF1, Cell growth regulator with EF hand domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGREF1Q99674 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CGREF1Q99674 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGREF1Q99674 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms