Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PKP4Q99569 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PKP4Q99569 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms