Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VAT1Q99536 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAT1Q99536 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms