Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EYA3Q99504 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EYA3Q99504 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EYA3Q99504 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms