Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NAP1L3Q99457 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NAP1L3Q99457 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms