Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBL7Q96S82 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
UBL7Q96S82 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
UBL7Q96S82 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms