Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMG1Q96Q15 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMG1Q96Q15 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMG1Q96Q15 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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