Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRNT1Q96Q11 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TRNT1Q96Q11 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRNT1Q96Q11 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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