Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC115Q96NT0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCDC115Q96NT0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CCDC115Q96NT0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms