Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PCMTD1Q96MG8 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCMTD1Q96MG8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCMTD1Q96MG8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms