Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR7

PHACTR3, Phosphatase and actin regulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR3Q96KR7 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PHACTR3Q96KR7 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PHACTR3Q96KR7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PHACTR3Q96KR7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms