Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms