Protein–RNA interactions for Protein: Q96KA5

CLPTM1L, Cleft lip and palate transmembrane protein 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1LQ96KA5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CLPTM1LQ96KA5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CLPTM1LQ96KA5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms