Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LRIG1Q96JA1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LRIG1Q96JA1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LRIG1Q96JA1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms