Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RAX2Q96IS3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RAX2Q96IS3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms