Protein–RNA interactions for Protein: Q96H20

SNF8, Vacuolar-sorting protein SNF8, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNF8Q96H20 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNF8Q96H20 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNF8Q96H20 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNF8Q96H20 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms