Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
BCANQ96GW7 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
BCANQ96GW7 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC32.92■■■□□ 2.86
BCANQ96GW7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms