Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF185Q96GF1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
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RNF185Q96GF1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RNF185Q96GF1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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RNF185Q96GF1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RNF185Q96GF1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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