Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BICD1Q96G01 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BICD1Q96G01 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BICD1Q96G01 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms