Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MISP3Q96FF7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MISP3Q96FF7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms