Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RNFT2Q96EX2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RNFT2Q96EX2 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RNFT2Q96EX2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms