Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FBXO17Q96EF6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FBXO17Q96EF6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms