Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCDC126Q96EE4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC126Q96EE4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC126Q96EE4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms