Protein–RNA interactions for Protein: Q96DS6

MS4A6E, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6E, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A6EQ96DS6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MS4A6EQ96DS6 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MS4A6EQ96DS6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms