Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PGBD4Q96DM1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PGBD4Q96DM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms