Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX6

LRRC58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC58Q96CX6 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LRRC58Q96CX6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LRRC58Q96CX6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms