Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
OPTNQ96CV9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
OPTNQ96CV9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms