Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ3

TRIM43, Tripartite motif-containing protein 43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM43Q96BQ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM43Q96BQ3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM43Q96BQ3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
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