Protein–RNA interactions for Protein: Q96AW1

VOPP1, Vesicular, overexpressed in cancer, prosurvival protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VOPP1Q96AW1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VOPP1Q96AW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
VOPP1Q96AW1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VOPP1Q96AW1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms